Update analyse-syndrome-grippal.Rmd

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...@@ -133,8 +133,8 @@ with(tail(data, 200), plot(date, inc, type="l", xlab="Date", ylab="Incidence heb ...@@ -133,8 +133,8 @@ with(tail(data, 200), plot(date, inc, type="l", xlab="Date", ylab="Incidence heb
L'argument `na.rm=True` dans la sommation précise qu'il faut supprimer les points manquants. Ce choix est raisonnable car il n'y a qu'un seul point manquant, dont l'impact ne peut pas être très fort. L'argument `na.rm=True` dans la sommation précise qu'il faut supprimer les points manquants. Ce choix est raisonnable car il n'y a qu'un seul point manquant, dont l'impact ne peut pas être très fort.
```{r} ```{r}
pic_annuel = function(annee) { pic_annuel = function(annee) {
debut = paste0(annee-1,"-08-01") debut = paste0(annee-1,"-09-01")
fin = paste0(annee,"-08-01") fin = paste0(annee,"-09-01")
semaines = data$date > debut & data$date <= fin semaines = data$date > debut & data$date <= fin
sum(data$inc[semaines], na.rm=TRUE) sum(data$inc[semaines], na.rm=TRUE)
} }
...@@ -142,7 +142,7 @@ pic_annuel = function(annee) { ...@@ -142,7 +142,7 @@ pic_annuel = function(annee) {
Nous devons aussi faire attention aux premières et dernières années de notre jeux de données. Les données commencent en octobre 1984, ce qui ne permet pas de quantifier complètement le pic attribué à 1985. Nous l'enlevons donc de notre analyse. Par contre, pour une exécution en octobre 2018, les données se terminent après le 1er août 2018, ce qui nous permet d'inclure cette année. Nous devons aussi faire attention aux premières et dernières années de notre jeux de données. Les données commencent en octobre 1984, ce qui ne permet pas de quantifier complètement le pic attribué à 1985. Nous l'enlevons donc de notre analyse. Par contre, pour une exécution en octobre 2018, les données se terminent après le 1er août 2018, ce qui nous permet d'inclure cette année.
```{r} ```{r}
annees = 1986:2018 annees = 1986:2017
``` ```
Nous créons un nouveau jeu de données pour l'incidence annuelle, en applicant la fonction `pic_annuel` à chaque année: Nous créons un nouveau jeu de données pour l'incidence annuelle, en applicant la fonction `pic_annuel` à chaque année:
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