Merge branch 'master' of...

Merge branch 'master' of https://app-learninglab.inria.fr/moocrr/gitlab/b8d70ed5df9a80c9b57b988df57c3e93/mooc-rr

journal/journal_de_bord.md

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 **Etiquettes et logiciels d'indexation**
 - existence de moteurs de recherche de bureau (par ex. *DocFetcher*) : peut localiser l'occurrence d'un mot dans une collection de fichiers
-- en cas d'abondance d'occurrences, l'ajout d'étiquettes / mots clés peut être utile, y compris pour des fichiers non textes
+- en cas d'abondance d'occurrences, l'ajout d'étiquettes / mots clés peut être utile, y compris pour des fichiers non textes
\ No newline at end of file
+
+## Module 2 
+
+**Document computationnel*
+
+Description :
+- Contenu : commentaires, code, données, résultats de calculs, liens hypertextes, images etc.
+- Fonctionnalités : documentation du code, inspection explication et réexécution des calculs 
+si l'environnement d'origine est disponible, possibilité d'utiliser plusieurs langage)
+- Intérêts : traçabilité des calculs, accès à l'ensemble des calculs sous-jacents, présentation/partage des travaux
+- Environnements possibles : Rstudio, Emacs/OrgMode, Jupyter
+
+Pour le travail collaboratif :
+- avantages : prise en main aisée, tout dans un seul document (!), transparence et réutilisation possible
+- points d'attention : vérifier le fonctionnement sur chaque machine, les installations/mises à jour, fausses manips des collaborateurs
+- pour la mise à disposition de façon pérenne : Gitlab, Github ou archive ouverte (HAL, figshare, zenodo)
+
+**Intérêt de RStudio**
+
+Les bonus +  
+- historique bien structuré, traçabilité de l'inspection des données
+- sauvegarde des résultats intermédiaires
+- liens entre les figures et calculs établis par le code
+- permet de générer des documents au format HTML, PDF, ou .doc(x)/.odt
+
+En cas d'utilisation du langage Python, Rstudio comporte quelques limites : non complétion sur les noms de variables ;
+non-persistance des variables et de leur état pour les codes Python ; seules les sorties textes sont gérées.
+
+Trucs et astuces :
+- utiliser les fonctions d'export et de réexécution du code depuis le début
+- apprendre les raccourcis claviers
+- lire la documentation et les pense-bêtes
+
+**Quid des autres environnements ?**
+
+| Environnement | Origine | Technologie | Utilisation | Navigation | Format | Article ? |
+| ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ |
+| Jupyter | 2001 | Web App., Python | Facile | Limitée | JSON | Difficile |
+| Rstudio/knitr | 2011-2014 | IDE, Java/R | Facile  | Limitée | Rmd | Oui |
+| Org-Mode | 1976/2008 | Editeur, EmacsLisp | Plus complexe | Puissante | Org | Oui|
+