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b8d70ed5df9a80c9b57b988df57c3e93
mooc-rr
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68b857f5
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68b857f5
authored
Aug 04, 2023
by
b8d70ed5df9a80c9b57b988df57c3e93
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68b857f5
...
@@ -19,3 +19,44 @@
...
@@ -19,3 +19,44 @@
**Etiquettes et logiciels d'indexation**
**Etiquettes et logiciels d'indexation**
-
existence de moteurs de recherche de bureau (par ex.
*DocFetcher*
) : peut localiser l'occurrence d'un mot dans une collection de fichiers
-
existence de moteurs de recherche de bureau (par ex.
*DocFetcher*
) : peut localiser l'occurrence d'un mot dans une collection de fichiers
-
en cas d'abondance d'occurrences, l'ajout d'étiquettes / mots clés peut être utile, y compris pour des fichiers non textes
-
en cas d'abondance d'occurrences, l'ajout d'étiquettes / mots clés peut être utile, y compris pour des fichiers non textes
## Module 2
**
Document computationnel
*
Description :
-
Contenu : commentaires, code, données, résultats de calculs, liens hypertextes, images etc.
-
Fonctionnalités : documentation du code, inspection explication et réexécution des calculs
si l'environnement d'origine est disponible, possibilité d'utiliser plusieurs langage)
-
Intérêts : traçabilité des calculs, accès à l'ensemble des calculs sous-jacents, présentation/partage des travaux
-
Environnements possibles : Rstudio, Emacs/OrgMode, Jupyter
Pour le travail collaboratif :
-
avantages : prise en main aisée, tout dans un seul document (!), transparence et réutilisation possible
-
points d'attention : vérifier le fonctionnement sur chaque machine, les installations/mises à jour, fausses manips des collaborateurs
-
pour la mise à disposition de façon pérenne : Gitlab, Github ou archive ouverte (HAL, figshare, zenodo)
**Intérêt de RStudio**
Les bonus +
-
historique bien structuré, traçabilité de l'inspection des données
-
sauvegarde des résultats intermédiaires
-
liens entre les figures et calculs établis par le code
-
permet de générer des documents au format HTML, PDF, ou .doc(x)/.odt
En cas d'utilisation du langage Python, Rstudio comporte quelques limites : non complétion sur les noms de variables ;
non-persistance des variables et de leur état pour les codes Python ; seules les sorties textes sont gérées.
Trucs et astuces :
-
utiliser les fonctions d'export et de réexécution du code depuis le début
-
apprendre les raccourcis claviers
-
lire la documentation et les pense-bêtes
**Quid des autres environnements ?**
| Environnement | Origine | Technologie | Utilisation | Navigation | Format | Article ? |
| ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ | ------ |
| Jupyter | 2001 | Web App., Python | Facile | Limitée | JSON | Difficile |
| Rstudio/knitr | 2011-2014 | IDE, Java/R | Facile | Limitée | Rmd | Oui |
| Org-Mode | 1976/2008 | Editeur, EmacsLisp | Plus complexe | Puissante | Org | Oui|
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