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journal/Journal-de-bord_MOOC-RR_Marc-Oudart.md

+---
+title: "MOOC RR RMarkdown"
+author: "Marc"
+date: "02/04/2020"
+output: html_document
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+
+```{r setup, include=FALSE}
+knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
+```
+# Titre d'une section
+## Titre d'une sous-section
+Conversion en html, PDF ou docx par Pandoc
+Pandoc installé par le site pandoc 
+Fichier texte en UTF-8 pour être lu sur tous les ordis et pérenne
+italique : _s_ ou *s*
+gras : __s__
+chasse fixe : 's'
+barré : ~~s~~
+hyperlien : [titre] url entre parenthèse
+Commentaire : <!-- s -->
+image : ![légende] adresse url ou locale entre parenthèse
+Mettre du code dans une ligne : avec des guillemets (Altgr + 7) --> `code`
+Ajouter un bloc de code entre 3 guillemets :
+```
+Bloc de code
+```
+
+Listes : 
+-
+-
+-
+
+Enumération :
+1.
+2.
+3.
+
+Imbrication avec tabulation
+
+# Utilisation Pandoc
+
+Avec la console.
+Se mettre dans le dossier avec cd.
+Conversion en pls formats : pandoc fichier.md -o fichier.extension (html, pdf, docx)
+
+Utiliser __Emacs__ ou __Vim__ pour passer d'un logiciel à l'autre
+
+# TEI : texte encoding initiative --> format de balisage standard
+Plutôt pour les SHS
+
+# Git
+Git est un logiciel permettant la gestion des versions pérennes.
+## Commandes 
+_git add_ --> indiquer les modifs que l'on souhaite conserver pour intégrer les parties de modifications logiques
+_git commit_ --> faire un checkpoint (version)
+_git diff_ --> pour voir la différence entre 2 versions
+_git checkout_ --> revenir à l'état antérieur
+
+Etape :
+1. Créer un projet sur Gitlab
+2. Commande _git clone_ pour récupérer un historique vierge sur son ordinateur
+3. Travailler avec _git add_ et git commit pour créer pls versions
+4. Commande _git push_ pour propager ses modifs sur le serveur Gitlab
+Uniquement de la branche d'historique principale (sauf si on le spécifie autrement)
+On synchronise des branches en échangeant des morceaux d'historique.
+
+### Collaborer à pls 
+- Si travail séquentiel
+1. Bob fait un _git push_ pour synchroniser sa version master avec le serveur Gitlab
+2. Alice fait _git __pull__ _ pour récupérer du serveur la bonne version master.
+- Si ils travaillent en même temps sur parties différentes
+1. Bob et Alice modifient de parties différentes
+2. Alice fait un _git push_
+3. Bob fait _git push_ --> erreur : d'abord _git pull_ puis _git push_
+--> Fusion des modifications
+- Si ils travaillent en même temps sur parties identiques
+4. Bob va avoir conflit avec son _git pull_ --> gestion du conflit --> _git push_
+
+### autres sur git
+Afficher historique : _git log_
+Merge : _git merge_
+
+Hébergement Git, interfaces web Github et Gitlab
+
+Possibilité de déversement vers des archives telle que Zenodo.
+
+Interfaces graphiques : Jupyter, RStudio, Emacs org-mode
+
+## Installation de git dans RStudio
+
+Installation de _Git_ sur le site web de [Git](https://git-scm.com/downloads).
+Interface graphique par défaut de Git est Notepad++ mais possibilité d'utilisé autre logiciel (comme R
+Studio).
+
+### Configuration de Git
+Dans le terminal :
+_git config --global user.name "marc.oudart"_
+_git config --global user.email "marc.oudart@college-de-france.fr"_
+
+### Dans RStudio
+1. _Tools --> Global options --> Git_
+2. _OK_
+3. _Create new project_
+4. __Check _Create a git repository for this project_ __
+
+A droite dans RStudio --> onglet Git.
+Check les fichiers pour stagged (comme _git add_).
+Commit.
+Donner un titre au commit.
+
+Créer nouveau fichier RMarkdown.
+Commit.
+
+_Knit_ en html.
+Commit.
+
+# Etiquetage et indexation
+## DocFetcher
+
+Installation de _DocFetcher_ sur internet [DocFetcher](http://docfetcher.sourceforge.net/fr/download.html)
+
+- Ajouter des étiquettes en commentaires en Markdown. Le mot sera encadré par des ";" pour ne pas que DocFetcher confonde l'étiquette avec un vrai mot.
+- Utilisation DocFetcher :
+Dire à gauche quel dossier indexer (et préciser si .md et .org sont à considérer comme fichiers textes).
+Puis rechercher un mot clé.
+
+## ExifTool
+Rajouter des étiquettes sur des images ou des fichiers PDF en ligne de commande :
+_exiftool -comment: ";étiquette;" (adresse de l'image)
+
+<!-- ## R Markdown
+
+This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.
+
+When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
+
+```{r cars}
+summary(cars)
+```
+
+## Including Plots
+
+You can also embed plots, for example:
+
+```{r pressure, echo=FALSE}
+plot(pressure)
+```
+
+Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.
+-->
\ No newline at end of file