Le plus gros du travail évalué par les pairs.

EvalPairs/EvalPairs.org~

+#+TITLE: Analyse de la pandémie de COVID-19
+#+AUTHOR: Émile Jetzer
+#+DATE: 19 mai 2020
+#+LANGUAGE: fr
+
+#+HTML_HEAD: <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/css/htmlize.css"/>
+#+HTML_HEAD: <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/css/readtheorg.css"/>
+#+HTML_HEAD: <script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/2.1.3/jquery.min.js"></script>
+#+HTML_HEAD: <script src="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.4/js/bootstrap.min.js"></script>
+#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/lib/js/jquery.stickytableheaders.js"></script>
+#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/js/readtheorg.js"></script>
+
+* Tâche
+
+Le but est ici de reproduire des graphes semblables à ceux du
+[[https://www.scmp.com/][South China Morning Post (SCMP)]], sur la page [[https://www.scmp.com/coronavirus?src=homepage_covid_widget][The Coronavirus
+Pandemic]] et qui montrent pour différents pays le nombre cumulé
+(c'est-à-dire le nombre total de cas depuis le début de
+l'épidémie) de personnes atteintes de la [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Maladie_%C3%A0_coronavirus_2019][maladie à coronavirus
+2019]].
+
+* Obtention des données
+Les données que nous utiliserons dans un premier temps sont
+compilées par le Johns Hopkins University Center for Systems
+Science and Engineering (JHU CSSE) et sont mises à disposition
+sur GitHub. C'est plus particulièrement sur les données
+=time_series_covid19_confirmed_global.csv= (des suites chronologiques
+au format csv) disponibles à l'adresse plus bas, que nous allons nous
+concentrer.
+
+** Téléchargement
+
+#+NAME: adresse
+| https://raw.githubusercontent.com/CSSEGISandData/COVID-19/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_time_series/time_series_covid19_confirmed_global.csv |
+
+#+NAME: fichier
+| covid-19.csv |
+
+#+NAME: telechargement
+#+BEGIN_SRC python :session Py :results output :var adresse=adresse[0, 0] chemin=fichier[0, 0]
+from urllib.request import urlopen
+from pathlib import Path
+
+print('Répertoire de travail:', Path.cwd())
+
+fichier = Path(chemin).resolve()
+
+# Nous n'avons à télécharger le fichier qu'une seule fois
+if not fichier.exists():
+    with urlopen(adresse) as distant:
+        texte = distant.read().decode('UTF-8')
+        with fichier.open('w') as local:
+            local.write(texte)
+
+print(fichier)
+#+END_SRC
+
+#+RESULTS: telechargement
+: Répertoire de travail: /Users/ejetzer/Documents/École/Résultats reproductibles/mooc-rr/EvalPairs
+: 
+: 
+: 
+: 'org_babel_python_eoe'
+: /Users/ejetzer/Documents/École/Résultats reproductibles/mooc-rr/EvalPairs/covid-19.csv
+
+#+NAME: apercu
+#+BEGIN_SRC zsh :session Shell :results output :var fichier=fichier
+cat $fichier
+#+END_SRC
+
+#+NAME: importation
+#+BEGIN_SRC python :session Py :results output
+import pandas as pd
+
+df = pd.read_csv(fichier)
+#+END_SRC