Avancement module 2

journal/module 2 - document computationnel

+# Module 2 - Document Computationnel
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+présenter travaux + accéder ensemble des calculs
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+- Jupyter
+- R Studio
+- OrgMode (basé sur Emacs)
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+## Exemple travaux controversés
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+- Economie, lien dette-croissance, initialement non publication des détails de calculs -> adjustements douteux
+- IRM: problème liés aux analyses statistiques: potientiellement milliers d'études invalides, données non re-vérifiables car non conservés (trop volumineuses)
+- Structures protéines: retraction, découverte erreur de programmation (inversion colonnes) dans code analyse
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+=> Problèmes de réproduction, même dans journaux préstigieux
+Parfois manque rigueur ou transparence
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+## Difficultés de la reproduction scientifique
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+- manque informations (données, procédures, choix) -> expliciter dans cahier laboratoire
+- ordinateur = source d'erreurs (logiciels trop complexes ou non transparent)
+- sauvegarde / organisation des données
+- article ~= version simplifiée
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+Importance d'utiliser les bons logiciels, ouvert pour faciliter la lecture plus tard
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+Sauvegarder les données