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parent 2ae2db1b
{
"cells": [],
"cells": [
{
"cell_type": "markdown",
"metadata": {},
"source": [
"# Incidence de la varicelle"
]
},
{
"cell_type": "code",
"execution_count": 1,
"metadata": {},
"outputs": [],
"source": [
"%matplotlib inline\n",
"import matplotlib.pyplot as plt\n",
"import pandas as pd\n",
"import isoweek"
]
},
{
"cell_type": "markdown",
"metadata": {
"hideCode": true
},
"source": [
"Les données de l'incidence de la varicelle sont disponibles sur le site web du [Réseau Sentinelles](https://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-7.csv). Ces données ont été téléchargées sous la forme d'un fichier en format CSV. Elles seront extraites ici à partir du fichier télécharger et non pas à partir de l'adresse URL du fichier, afin de prévenir un potentiel changement d'URL ou une modification de la version du jeu de données utilisé."
]
},
{
"cell_type": "code",
"execution_count": null,
"metadata": {},
"outputs": [],
"source": [
"raw_data = pd.read_csv(\"incidence-PAY-7.csv\", skiprows=1)"
]
},
{
"cell_type": "markdown",
"metadata": {},
"source": [
"Voici l'explication des colonnes données [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json):\n",
"\n",
"| Nom de colonne | Libellé de colonne |\n",
"|----------------|-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------|\n",
"| week | Semaine calendaire (ISO 8601) |\n",
"| indicator | Code de l'indicateur de surveillance |\n",
"| inc | Estimation de l'incidence de consultations en nombre de cas |\n",
"| inc_low | Estimation de la borne inférieure de l'IC95% du nombre de cas de consultation |\n",
"| inc_up | Estimation de la borne supérieure de l'IC95% du nombre de cas de consultation |\n",
"| inc100 | Estimation du taux d'incidence du nombre de cas de consultation (en cas pour 100,000 habitants) |\n",
"| inc100_low | Estimation de la borne inférieure de l'IC95% du taux d'incidence du nombre de cas de consultation (en cas pour 100,000 habitants) |\n",
"| inc100_up | Estimation de la borne supérieure de l'IC95% du taux d'incidence du nombre de cas de consultation (en cas pour 100,000 habitants) |\n",
"| geo_insee | Code de la zone géographique concernée (Code INSEE) http://www.insee.fr/fr/methodes/nomenclatures/cog/ |\n",
"| geo_name | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) |\n",
"\n",
"La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skiprows=1`."
]
},
{
"cell_type": "code",
"execution_count": null,
"metadata": {},
"outputs": [],
"source": []
}
],
"metadata": {
"kernelspec": {
"display_name": "Python 3",
......@@ -16,10 +83,9 @@
"name": "python",
"nbconvert_exporter": "python",
"pygments_lexer": "ipython3",
"version": "3.6.3"
"version": "3.6.4"
}
},
"nbformat": 4,
"nbformat_minor": 2
}
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