**Disclaimer:** The two sections *A simple "reproducible research" emacs configuration* and *A stub of replicable article* explain how to set up emacs/org-mode for this MOOC. These are very important sections in the context of this MOOC. **These sections are illustrated in two out of the [three video tutorials of this sequence](https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session02/jump_to_id/9cfc7500f0ef46d288d2317ec7b037b4), and****which you really should follow carefully**. **Otherwise, you may have trouble doing the exercises later on**. Likewise, I strongly encourage you to watch the ["emacs and git" video tutorial available at the same place](https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session02/jump_to_id/9cfc7500f0ef46d288d2317ec7b037b4).
**This document is particularly important if you follow the RStudio or the Org-Mode path.****If you follow the Jupyter path, it can be ignored at first****as we have closely integrated Jupyter and GitLab in the context of this MOOC.**
So far, you only used git via the web interface from the GitLab we deployed for the MOOC: <https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/>
**Ce document est particulièrement important si vous suivez le parcours RStudio ou Org-Mode. Vous pouvez l’ignorer dans un premier temps si****vous suivez le parcours Jupyter car nous avons étroitement intégré Jupyter et GitLab dans le contexte de ce MOOC.**
Jusqu'à présent, vous avez utilisé Git uniquement via l'interface web du GitLab que nous avons déployée pour le MOOC : [<https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/>](https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/)
...
...
@@ -252,5 +258,3 @@ Maintenant, commençons !
```
Alors seulement pourrez-vous exécuter le `git push`.
@@ -25,4 +31,3 @@ Here are a few links to other kind of examples:
- a set of templates for various computer science journals/conferences: [IEEE](https://github.com/schnorr/ieeeorg), [Wiley](https://github.com/schnorr/wileyorg), [ACM](https://github.com/schnorr/acmorg), [LNCS](https://github.com/schnorr/llncsorg)
- his lecture on programming languages for undergrads: <https://github.com/schnorr/mlp/tree/master/conteudo>
- John Kitchin is an expert org-mode user and he maintains a very interesting [blog with many interesting tips](http://kitchingroup.cheme.cmu.edu/blog/). You may want to check this [seminar he gave at SciPy](https://www.youtube.com/watch?v=IsSMs-4GlT8&list=FLQp2VLAOlvq142YN3JO3y8w&app=desktop).
**NB**: You won't be able to propagate your modifications on GitLab if some modifications have been done on GitLab in the meantime. 
- You should first merge these remote modifications locally. Click on `pull` to get these modifications on your machine.
@@ -442,4 +448,3 @@ There are a few potential issues that may arise with installing older versions o
- You may be losing functionality or bug fixes that are only present in the newer versions of the packages.
- The older package version needed may not be compatible with the version of R you have installed. In this case, you will either need to downgrade R to a compatible version or update your R code to work with a newer version of the package.
@@ -444,4 +450,3 @@ Quelques problèmes sont susceptibles de survenir lors de l'installation d'ancie
- Vous pouvez perdre des fonctionnalités ou des corrections de bugs qui ne sont présentes que dans les versions les plus récentes des packages.
- L'ancienne version de package requise peut ne pas être compatible avec la version de R que vous avez installée. Dans ce cas, vous devrez soit rétrograder R vers une version compatible, soit mettre à jour votre code R pour qu'il fonctionne avec une version plus récente du package.
Experimentation was not covered in this MOOC, although it is an essential part of science. The main reason is that practices and constraints can vary so wildly from one domain to another that it could not be properly covered in a first edition. We would be happy to gather references you consider as interesting in your domain so do not hesitate to provide us with such references by using the forum and we will update this page.
-[A recent talk by Lucas Nussbaum on Experimental Testbeds in Computer Science](https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/9_experimental_testbeds/index.org).
L'expérimentation n'est pas couverte dans ce MOOC bien qu'il s'agisse d'un élément essentiel de la science. La raison principale est que les pratiques et les contraintes varient tellement d'un domaine à l'autre que ce thème ne pouvait pas être correctement couvert dans une première édition. Nous serions heureux de rassembler les références que vous jugez intéressantes dans votre domaine. N'hésitez donc pas à nous les fournir à l'aide du forum. Nous les intégrerons dans cette page.
-[Une récente conférence de Lucas Nussbaum sur les bancs d’essais expérimentaux en informatique](https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/9_experimental_testbeds/index.org).
