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module4/ressources/exo2.html

-<h2 id="org1f802ba">Exercice 2 : L'importance de l'environnement</h2>
-<div class="outline-text-2" id="text-org1f802ba">
-<p>
-Dans cet exercice, nous vous proposons de reprendre l'exercice
-précédent mais en mettant à jour l'environnement de calcul. En effet,
-nous avons rencontré des surprises en préparant ce MOOC puisqu'il nous
-est arrivé d'avoir des résultats différents entre nos machines et
-l'environnement Jupyter que nous avions mis en place pour le MOOC. Ça
-sera peut-être également votre cas !
-</p>
-
-<ol class="org-ol">
-<li>Pour ceux qui ont suivi le parcours Jupyter, recréez
-l'environnement du MOOC sur votre propre machine en suivant les
-instructions données 
-<a href="https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session01bis/jump_to_id/4ab5bb42ca1e45c8b0f349751b96d405">dans les ressources de la section 4A du module 2</a>.</li>
-<li>Vérifiez si vous obtenez bien les mêmes résultats que ceux
-attendus.</li>
-<li>Mettez à jour (vers le haut ou vers la bas) cet environnement et
-vérifiez si vous obtenez les mêmes résultats.</li>
-</ol>
-
-<p>
-Comme précédemment, vous mettrez à jour le <a href="https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md">tableau</a> et vous discuterez
-sur le forum des succès et des échecs que vous aurez rencontrés.
-</p>
-</div>
-</div>
-
-<div id="outline-container-org1a24dbb" class="outline-2">
-<h2 id="org1a24dbb"><span  style="color: #b62567;">The importance of the environment</span></h2>
-<div class="outline-text-2" id="text-org1a24dbb">
-<p style="color: #b62567;">
-In this exercise, we ask you to redo the preceding exercise after
-updating the computational environment. When preparing this MOOC, we
-had a few surprises due to different results on our own computers and
-on the Jupyter environment that we had installed for the MOOC. Maybe
-that will happen to you as well!
-</p>
-
-<ol class="org-ol">
-<li style="color: #b62567;">For those you followed the Jupyter path, re-create the MOOC's Jupyter environment on your own computer by following the instructions given
-<a href="https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session01bis/jump_to_id/4ab5bb42ca1e45c8b0f349751b96d405">in the resource section of sequence 4A of module 2</a>.</li>
-<li style="color: #b62567;">Check if you get the same results as in the MOOC environment.</li>
-<li style="color: #b62567;">Update this environment, increasing or decreasing some package's version numbers, and check if the results are still the same.</li>
-</ol>
-
-<p style="color: #b62567;">
-As before, you can add your observations to the <a href="https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md">table</a> and discuss your successes and failures on the forum.
-</p>
-</div>

module4/ressources/exo3.html

-<div id="outline-container-org5b10dc4" class="outline-2">
-<h2 id="org5b10dc4">Exercice 3 : Répliquer un papier de ReScience</h2>
-<div class="outline-text-2" id="text-org5b10dc4">
-<p>
-ReScience (<a href="http://rescience.github.io/">http://rescience.github.io/</a>) est un journal de sciences
-computationnelles entièrement ouvert dont l'objectif est d'encourager
-la réplication de travaux déjà publiés en s'assurant que l'ensemble du
-code et des données soit disponible. Pour chacun des articles publiés
-dans ReScience, nous avons la garantie qu'au moins two chercheurs
-indépendants ont réussi à suivre les indications, à ré-exécuter le
-code et à ré-obtenir les mêmes résultats que ceux décrits par les
-auteurs. Cela ne veut pas dire que cela soit parfaitement automatique
-pour autant et il peut être intéressant de voir comment ils ont
-procédé.
-</p>
-
-<p>
-Nous vous proposons donc de choisir l'un de ces articles (celui avec
-lequel vous avez le plus d'affinité) et d'essayer de réexécuter les
-codes et les calculs décrits dans l'article. N'hésitez pas à indiquer
-vos difficultés éventuelles sur le forum où nous répondrons à vos questions.
-</p>
-</div>
-</div>
-
-<div id="outline-container-org60c7839" class="outline-2">
-<h2 id="org60c7839" style="color: #b62567;">Replicate a paper from ReScience</h2>
-<div class="outline-text-2" id="text-org60c7839">
-<p style="color: #b62567;">
-ReScience (<a href="http://rescience.github.io/">http://rescience.github.io/</a>) is a scientific journal for
-computational science that is completely open and has the goal of
-encouraging the replication of already published work while providing
-a complete set of code and data. For each article published in
-ReScience, we know that at least two independent researchers (the
-reviewers) have been able to follow the instructions, re-execute the
-code, and obtain the same results as those described by the
-authors. This doesn't mean that the process is fully automatic, and
-therefore it is of interest to see how they have proceeded.
-</p>
-
-<p style="color: #b62567;">
-We ask you to choose one of the articles (the one that you like most)
-and to try to re-execute the code as described in the article. Don't
-hesitate to indicate any difficulties you might encounter in the
-forum, where we will reply to your questions&#x2026;
-</p>
-</div>