maj

208c4d11 · Helene31 · 8eddb253 · 208c4d11 · 208c4d11
Commit 208c4d11 authored Apr 21, 2020 by Helene31
Show whitespace changes
Inline Side-by-side

Showing with 148 additions and 0 deletions

covid19-du-2020-03-04-au-2020-03-25.csv module2/exo4/covid19-du-2020-03-04-au-2020-03-25.csv +21 -0

journalHelene31.Rmd module2/exo4/journalHelene31.Rmd +127 -0

No files found.
--- a/module2/exo4/covid19-du-2020-03-04-au-2020-03-25.csv
+++ b/module2/exo4/covid19-du-2020-03-04-au-2020-03-25.csv
+Date;Auvergne-Rhone-Alpes;Bourgogne-Franche-Comté;Bretagne;Centre-Val de Loire;Corse;Grand Est;Hauts-de-France;Ile-de-France;Normandie;Nouvelle-Aquitaine;Occitanie;Pays de la Loire;PACA;Guadeloupe;Saint-Barth;Saint-Martin;Guyane;Martinique;Mayotte;La Réunion
+2020/03/04;49;16;23;0;0;38;65;55;2;5;9;7;13;3;0;0;0;0;0;0
+2020/03/05;64;39;29;2;3;77;74;76;6;8;11;8;18;3;0;0;5;0;0;0
+2020/03/06;75;78;32;11;3;136;97;89;11;11;18;16;26;0;1;2;5;2;0;0
+2020/03/07;102;129;40;16;5;250;173;104;11;17;36;18;38;0;1;2;5;2;0;0
+2020/03/10;249;123;83;19;42;489;249;468;40;57;70;31;110;0;1;2;5;3;0;0
+2020/03/11;264;155;94;20;51;578;263;492;54;66;87;34;111;0;1;2;5;3;0;1
+2020/03/12;329;219;117;30;64;699;349;577;68;87;133;41;147;0;1;2;6;4;0;3
+2020/03/13;416;272;155;33;85;911;397;721;97;114;172;55;212;1;1;2;6;6;0;5
+2020/03/14;454;339;182;54;106;1085;466;949;127;130;214;82;281;3;1;2;7;10;1;6
+2020/03/15;523;412;207;71;115;1378;507;1209;143;144;243;98;330;6;3;2;7;15;1;9
+2020/03/16;618;507;233;90;126;1543;585;1762;156;178;262;108;405;18;3;2;11;16;1;9
+2020/03/17;710;549;247;103;145;1820;612;2177;174;200;311;126;478;27;3;3;11;19;3;12
+2020/03/18;858;593;273;128;152;2163;665;2693;208;237;371;128;574;33;3;4;11;23;3;14
+2020/03/19;1014;696;297;157;162;2643;700;3384;241;280;444;160;693;45;3;4;15;32;6;19
+2020/03/20;1101;770;346;219;168;3006;759;3818;287;432;537;190;826;51;3;4;15;32;7;38
+2020/03/21;1266;903;359;254;173;3089;791;4695;345;521;611;234;1041;56;3;5;18;37;11;47
+2020/03/22;1431;1178;397;291;183;3395;936;5283;462;612;671;270;1372;58;3;6;19;44;14;64
+2020/03/23;1730;1347;490;361;194;4256;1269;6211;511;676;767;293;1510;62;3;8;20;53;24;71
+2020/03/24;1857;1510;526;450;217;4922;1532;6798;586;789;900;343;1595;73;3;8;23;57;30;83
+2020/03/25;2093;1569;603;561;225;5479;1753;7660;688;912;1082;368;1927;76;3;11;28;66;35;94
--- a/module2/exo4/journalHelene31.Rmd
+++ b/module2/exo4/journalHelene31.Rmd
+---
+title: "Exercice 3 Module 2"
+author: "Hélène Raynal"
+date: "21 avril 2020"
+output: html_document
+---
+
+<img src="https://images-na.ssl-images-amazon.com/images/I/41w3Kf%2BAzBL._SX331_BO1,204,203,200_.jpg"  width="100"/>
+
+# Journal Hélène 31
+
+*Objet de ce document* 
+ce que vous apprenez dans ce MOOC: 
+les références qui vous paraissent utiles, etc.
+des données quotidiennes qui vous intéressent (temps, etc.). Vous les utiliserez par la suite dans le module 2.
+
+## Data
+
+| date      | weather      | temperature | hours |
+|:----------|:------------:|------------:|------:|
+|23/03/2020 | sunny        |      14     | 1     |
+|24/03/2020 | windy        |      14     | 1     |
+|25/03/2020 | windy        |      15     | 2     |
+|26/03/2020 | cloudy       |      10     | 3     |
+|27/03/2020 | sunny        |      18     | 0     |
+|28/03/2020 | sunny        |      18     | 0     |
+|29/03/2020 | cloudy       |      12     | 0     |
+|30/03/2020 | melted snow  |      4      | 2     |
+|31/03/2020 | melted snow  |      4      | 2     |
+|01/04/2020 | melted snow  |      4      | 2     |
+|02/04/2020 | sunny        |      15     | 0     |
+|03/04/2020 | sunny        |      15     | 0     |
+|04/04/2020 | sunny        |      15     | 0     |
+|05/04/2020 | sunny        |      18     | 0     |
+|06/04/2020 | sunny        |      15     | 2     |
+|15/04/2020 | sunny        |      16     | 1     |
+|16/04/2020 | sunny        |      15     | 3     |
+|20/04/2020 | rain         |      10     | 2     |
+|21/04/2020 | rain         |      7      | 3     |
+
+
+## Suivi des data coronavirus
+
+
+```{r }
+setwd("C:/Users/hraynal/EspaceTravailBadet/FORMATION_PERSO/2020-Reproductibilite/moocrr-reproducibility-study/module2/exo4")
+library(ggplot2)
+monDataset <- read.csv("covid19-du-2020-03-04-au-2020-03-25.csv", sep=";")
+#summary(monDataset)
+
+ggplot(monDataset) +
+    geom_point(aes(x = Date, y = Occitanie), 
+             color = "darkgreen")
+
+```
+
+
+## Module 1: Cahier de notes cahier de laboratoire
+### Nous utilisons tous des cahiers de notes, cahier de laboratoire
+### Un aperçu historique de la prise de note
+### Du fichier texte au  langage balisage léger
+
+- Tutoriel trés complet sur markdown et pandoc
+[https://enacit.epfl.ch/cours/markdown-pandoc/]
+
+- R Markdown: The Definitive Guide
+[https://bookdown.org/yihui/rmarkdown/]
+
+ -- Exemple Rmarkdown généré avec Rstudio[https://app-learninglab.inria.fr/moocrr/gitlab/moocrr-session3/moocrr-reproducibility-study/blob/master/testmarkdown.Rmd]  -  (Fichier html généré avec R studio)[SortieTestRmarkdown.html]
+ -- Résultat en html, fichier html généré avec Rstudio [https://app-learninglab.inria.fr/moocrr/gitlab/moocrr-session3/moocrr-reproducibility-study/blob/master/SortieTestRmarkdown.html]
+- Pandoc sur mon PC: 
+ -- installation sur poste de travail, puis ouvrir ligne de commande
+```
+C:\Users\hraynal\EspaceTravailBadet\FORMATION_PERSO\2020-Reproductibilite>pandoc -o carnet.pdf journalHelene31.md
+```
+
+### Pérennité et évolutivité des notes avec gitlab
+- question sur client git pour windows:
+*Trois outils sont proposés en semaine 2. Les trois outils permettent d’utiliser Git. 
+La solution avec RStudio me semble la plus simple à mettre en œuvre : RStudio / Utiliser Git avec RStudio (cf. onglet 3. RStudio : installation, documentation).*
+
+
+- Manip à faire pour versionner avec git depuis RStudio
+<<<<<<< HEAD
+
+ -- Créer un projet
+ 
+ -- (Bon tutoriel pour installation) [https://jennybc.github.io/2014-05-12-ubc/ubc-r/session03_git.html]
+ 
+ -- (Autre tuto envoyé par Eric)[happygitwithr.com/]
+ 
+ -- Pb "git: 'credential-cache' is not a git command"  Faire:To remove the message, "git: 'credential-cache' is not a git command.", run "git config --global --unset credential.helper" 
+ 
+ -- Depuis l'interface : cocher à droite le fichier dont on veut faire le commit
+ 
+ -- Bouton en haut "Git"
+ 
+ -- Commit  - compléter le message de commit
+ 
+ -- Push
+ 
+ -- Pb je n'arrivais pas à le faire en utilisant l'interface graphique car au départ il y avait des accents dans le nom du fichier. Je le fais en ligne de commande: git commit fichier, git push
+ 
+ -- Pb j'ai l'impression qu'il faut que je sois connectée à gitlab, et que j'ai fait un Save As du fichier. 
+
+ -- Créer un projet
+ 
+ -- (Bon tutoriel pour installation) [https://jennybc.github.io/2014-05-12-ubc/ubc-r/session03_git.html]
+ 
+ -- Pb "git: 'credential-cache' is not a git command"  Faire:To remove the message, "git: 'credential-cache' is not a git command.", run "git config --global --unset credential.helper" 
+ 
+ -- Depuis l'interface : cocher à droite le fichier dont on veut faire le commit
+ 
+ -- Bouton en haut "Git"
+ 
+ -- Commit
+ 
+ -- Push
+ 
+ -- Pb je n'arrive pas à le faire en utilisant l'interface graphique. Je le fais en ligne de commande:
+ 
+  --- git commit fichier  Puis git push
+
+
+### les étiquettes et logiciel d'indexation pour s'y retrouver
+### Supports de cours
+### exercices
\ No newline at end of file