## Module 1: Cahier de notes cahier de laboratoire
### Nous utilisons tous des cahiers de notes, cahier de laboratoire
### Un aperçu historique de la prise de note
### Du fichier texte au langage balisage léger
- Tutoriel trés complet sur markdown et pandoc
[https://enacit.epfl.ch/cours/markdown-pandoc/]
- R Markdown: The Definitive Guide
[https://bookdown.org/yihui/rmarkdown/]
-- Exemple Rmarkdown généré avec Rstudio[https://app-learninglab.inria.fr/moocrr/gitlab/moocrr-session3/moocrr-reproducibility-study/blob/master/testmarkdown.Rmd] - (Fichier html généré avec R studio)[SortieTestRmarkdown.html]
-- Résultat en html, fichier html généré avec Rstudio [https://app-learninglab.inria.fr/moocrr/gitlab/moocrr-session3/moocrr-reproducibility-study/blob/master/SortieTestRmarkdown.html]
- Pandoc sur mon PC:
-- installation sur poste de travail, puis ouvrir ligne de commande
### Pérennité et évolutivité des notes avec gitlab
- question sur client git pour windows:
*Trois outils sont proposés en semaine 2. Les trois outils permettent d’utiliser Git.
La solution avec RStudio me semble la plus simple à mettre en œuvre : RStudio / Utiliser Git avec RStudio (cf. onglet 3. RStudio : installation, documentation).*
- Manip à faire pour versionner avec git depuis RStudio
-- Créer un projet
-- (Bon tutoriel pour installation) [https://jennybc.github.io/2014-05-12-ubc/ubc-r/session03_git.html]
-- Pb "git: 'credential-cache' is not a git command" Faire:To remove the message, "git: 'credential-cache' is not a git command.", run "git config --global --unset credential.helper"
-- Depuis l'interface : cocher à droite le fichier dont on veut faire le commit
-- Bouton en haut "Git"
-- Commit - compléter le message de commit
-- Push
-- Pb je n'arrivais pas à le faire en utilisant l'interface graphique car au départ il y avait des accents dans le nom du fichier. Je le fais en ligne de commande: git commit fichier, git push
-- Pb j'ai l'impression qu'il faut que je sois connectée à gitlab, et que j'ai fait un Save As du fichier.
### les étiquettes et logiciel d'indexation pour s'y retrouver