Update analyse-syndrome-grippal.Rmd

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......@@ -21,9 +21,16 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
## Préparation des données
Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est:
Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente.
Les données sont téléchargées en local avant l'analyse.
```{r}
data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv"
data_file = "syndrome-grippal.csv"
if (!file.exists(data_file)) {
download.file(data_url, data_file, method="auto")
}
```
Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json):
......@@ -42,9 +49,10 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://
| `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) |
La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`.
### Téléchargement
### Lecture du dataset (dl en local)
```{r}
data = read.csv(data_url, skip=1)
data = read.csv(data_file, skip=1)
```
Regardons ce que nous avons obtenu:
......
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