pb transformation en .org

module1/ressources/ResearchTransparency_fr.org

@@ -19,27 +19,21 @@ les *enjeux de transparence* qui prédominent. Janz distingue 3 types de
 transparence (Janz 2018). Les objectifs à atteindre dans chaque domaine
 vont se traduire différemment selon que l'on travaille avec des méthodes
 quantitatives ou qualitatives : 
-- /data transparency/ : "/Providing full
-access to data itself/" ; il s'agit là de fournir les jeux de données
-sur lesquels se fonde l'analyse, mais Janz précise que la mise à
-disposition ne peut être que partielle si on utilise des transcriptions
+- /data transparency/ : "/Providing full access to data itself/" ; il s'agit là de fournir les jeux de données
+sur lesquels se fonde l'analyse, mais Janz précise que la mise à disposition ne peut être que partielle si on utilise des transcriptions
 d'entretiens, des vidéos. 
-- /analytic transparency/ : "/Information
-about data analysis/"; il peut s'agir de fournir les codes informatiques
-mais aussi d'indiquer précisement sur quelles sources l'analyse s'appuie
-ou encore d'apporter des commentaires complémentaires à l'analyse. 
-- /production transparency/ : "/Process of data collection/" ; il peut
-s'agir de fournir ou de décrire les données brutes, de documenter les
-variables. Mais l'objectif de transparence peut aussi consister à
-expliquer selon quels protocoles les données ont été collectées. On peut
+- /analytic transparency/ : "/Information about data analysis/"; il peut s'agir de fournir les codes informatiques
+mais aussi d'indiquer précisement sur quelles sources l'analyse
+s'appuie ou encore d'apporter des commentaires complémentaires à l'analyse. 
+- /production transparency/ : "/Process of data collection/" ; il peut s'agir de fournir ou de décrire les données brutes, de documenter les
+variables. Mais l'objectif de transparence peut aussi consister à expliquer selon quels protocoles les données ont été collectées. On peut
 par exemple détailler les critères de sélection des participants à une
 étude.
 
 *Toutes les techniques de reproductibilité n'auront donc pas la même
 importance en fonction des disciplines et des méthodes employées*.
 
-* Quelques exemples de pratiques favorables à une recherche
-reproductible ...
+* Quelques exemples de pratiques favorables à une recherche reproductible ...
    :PROPERTIES:
    :CUSTOM_ID: quelques-exemples-de-pratiques-favorables-à-une-recherche-reproductible
    :END:
@@ -75,8 +69,7 @@ Mais il existe également de nombreux cas où aucune de ces techniques ne
 s'applique (donnée ne pouvant être partagées, absence de dimension
 calculatoire ou informatique, etc.).
 
-* ... qui appellent d'autres réponses : la transparence, une notion
-centrale de la recherche reproductible. Mais de quoi parle-t-on alors ?
+* ... qui appellent d'autres réponses : la transparence, une notion centrale de la recherche reproductible. Mais de quoi parle-t-on alors ?
    :PROPERTIES:
    :CUSTOM_ID: qui-appellent-dautres-réponses-la-transparence-une-notion-centrale-de-la-recherche-reproductible.-mais-de-quoi-parle-t-on-alors
    :END:
@@ -132,8 +125,7 @@ mal : recherche des sources et analyse de la littérature ; saisie et
 traitement des données ; constitution des /corpus/ ; présentation des
 résultats ; rédaction.
 
-Par ailleurs, *nul besoin de travailler avec des bases de données, des
-données d'enquêtes ou encore des jeux de données massifs pour être
+Par ailleurs, *nul besoin de travailler avec des bases de données, des données d'enquêtes ou encore des jeux de données massifs pour être
 concerné.e par ces problématiques*. Par exemple, il peut être difficile
 pour un.e chercheur.euse d'évaluer la robustesse d'une hypothèse de
 recherche fondée sur la présence d'une expression donnée dans un
@@ -166,12 +158,10 @@ vérification. De fait, se pose la question du degré de contrôle possible
 de ces outils : *sous quelles conditions est-il raisonnable de s'en
 remettre à des traitements automatisés dès lors qu'on veut s'assurer
 d'une recherche transparente* ? Autant que faire se peut, le recours à
-des *logiciels /open source/* constitue une première étape dans ce sens
-: le code source des logiciels commerciaux demeure en effet
-inaccessible. Ensuite, acquérir progressivement un socle de compétences
+des *logiciels /open source/* constitue une première étape dans ce
+sens : le code source des logiciels commerciaux demeure en effet inaccessible. Ensuite, acquérir progressivement un socle de compétences
 techniques permet d'appréhender le fonctionnement général d'un logiciel.
-*Il ne s'agit pas forcément d'en comprendre le paramétrage dans le
-détail, mais d'avoir suffisamment de notions pour comprendre ce qu'on
+*Il ne s'agit pas forcément d'en comprendre le paramétrage dans le détail, mais d'avoir suffisamment de notions pour comprendre ce qu'on
 obtient en sortie et le crédit qu'on peut lui apporter*. Les
 ingénieur.e.s en traitement et analyse de données et les
 statisticien.ne.s des équipes de recherche peuvent vous aider à
@@ -207,13 +197,14 @@ and reclassification of coded data into different and even new
 categories./" (Saldaña 2016) Par ailleurs, non seulement les codes
 évoluent au fil de l'analyse, mais leur nombre peut aussi augmenter. La
 figure ci-dessous illustre le cycle de conception des codes (Roberts,
-Dowell, and Nie 2019). [[file:ROBERTS-cycle-codebook.png]]
+Dowell, and Nie 2019).
+
+ [[file:ROBERTS-cycle-codebook.png]]
 
 De fait, la nécessité de suivre ces évolutions s'impose tout du long du
 processus de recherche. Un /codebook/ peut répondre au besoin de suivi
-des évolutions puisqu'il s'agit d'*un document permettant d'une part, de
-recenser tous les codes appliqués, d'autre part, de consigner ses choix
-et de suivre leur évolution*. Ainsi, un /codebook/ représente plus qu'un
+des évolutions puisqu'il s'agit d'*un document permettant d'une part, de recenser tous les codes appliqués, d'autre part, de consigner ses
+choix et de suivre leur évolution*. Ainsi, un /codebook/ représente plus qu'un
 simple index. Il existe différents types de /codebooks/ : certains se
 focalisent sur la description des données. Le /codebook/ constitue un
 outil de suivi au service de la dimension interprétative du travail
@@ -307,8 +298,7 @@ contemporaine n° 58-4bis (5): 70--89.
 
 Janz, Nicole. 2018. 'Research Reproducibility in Political Science'.
 presented at the NCRM Research Methods Festival, University of Bath,
-July 5.
-https://www.ukdataservice.ac.uk/media/622140/janz\_rmf\_qualtransperency\_bath2018.pdf.
+July 5. https://www.ukdataservice.ac.uk/media/622140/janz_rmf_qualtransperency_bath2018.pdf.
 
 Nosek, Brian A., Charles R. Ebersole, Alexander DeHaven, and David
 Mellor. 2017. 'The Preregistration Revolution'. Open Science Framework,
@@ -339,18 +329,16 @@ diverse and inclusive community of editors, writers, and readers."
 gestion, partage*
 
 Andreassen, Helene N. 2019. 'How to Share Research Data'. University
-Library : The Arctic University of Norway, November 5.
-http://site.uit.no/rdmtraining/files/2019/11/En\_share\_2019-11-05.pdf.
+Library : The Arctic University of Norway, November 5. http://site.uit.no/rdmtraining/files/2019/11/En_share_2019-11-05.pdf.
 
 Andreassen, Helene N., and Erik Axel Vollan. 2018. 'Research Data
 Management Part 2: (Qualitative) Data Containing Personal/Sensitive
 Information'. University Library : The Arctic University of Norway,
 October 11.
-http://site.uit.no/rdmtraining/files/2018/10/TakeControlResearchData\_PART\_2\_Qualitative.pdf.
-
-Beagrie, Neil. 2019. 'What to Keep : A Jisc Research Data Study'. JISC.
-https://repository.jisc.ac.uk/7262/1/JR0100\_WHAT\_RESEARCH\_DATA\_TO\_KEEP\_FEB2019\_v5\_WEB.pdf.
+ http://site.uit.no/rdmtraining/files/2018/10/TakeControlResearchData_PART_2_Qualitative.pdf.
 
+Beagrie, Neil. 2019. 'What to Keep : A Jisc Research Data
+Study'. JISC.  https://repository.jisc.ac.uk/7262/1/JR0100_WHAT_RESEARCH_DATA_TO_KEEP_FEB2019_v5_WEB.pdf.
 Boistel, Romain, Frédérique Bordignon, and Lionel Maurel. 2019. 'Aspects
 Juridiques de La Gestion et Du Partage Des Données'. In Journées
 Nationales de La Science Ouverte 2019. Paris, France.

module1/ressources/SourcesAndBiblio_fr.org

@@ -40,8 +40,7 @@ La bibliographie constitue donc un faisceau d'indices de transparence
 pour un lectorat de chercheurs.euses : *la liste des sources est-elle
 exhaustive et représentative de l'ensemble des points de vue sur la question ou au contraire, présente-t-elle d'importants biais de sélection ?*
 
-* Gérer de la manière la plus systématique possible ses sources
-participe à réduire les erreurs de /reporting/
+* Gérer de la manière la plus systématique possible ses sources participe à réduire les erreurs de /reporting/
    :PROPERTIES:
    :CUSTOM_ID: gérer-de-la-manière-la-plus-systématique-possible-ses-sources-participe-à-réduire-les-erreurs-de-reporting
    :END:
@@ -71,7 +70,6 @@ d'évaluer le degré de fiabilité de la référence utilisée.
 
 * Adopter un style bibliographique pour identifier plus facilement les sources citées
 
-
 Que votre document fasse quatre ou mille pages, appliquer un style
 bibliographique vous permet d'éviter d'oublier de mentionner des
 éléments nécessaires à l'identification d'un document. Un style
@@ -113,18 +111,19 @@ Un gestionnaire de références bibliographiques permet entre autres
 de :
 
 - *importer des descriptions bibliographiques* depuis des catalogues, des moteurs de recherche, des sites web, des plateformes d'éditeurs 
-- centraliser* les références collectées et constituer ainsi sa base
+- *centraliser* les références collectées et constituer ainsi sa base
   de données personnelle, à la différence des outils proposés dans les
-  traitement de texte. Word permet par exemple de créer une base de données de références bibliographiques, mais celle-ci est propre à un
-document. Ainsi, pour citer dans plusieurs documents une même
-référence, je dois la créer dans chaque document. 
+  traitement de texte. Word permet par exemple de créer une base de
+  données de références bibliographiques, mais celle-ci est propre à
+  un document. Ainsi, pour citer dans plusieurs documents une même référence, je dois la créer dans chaque document. 
 - *exporter des références bibliographiques sous différents formats* : .html, .ris, .rtf 
 - *partager ses références* soit de manière récurrente en créant des
   bibliothèques de groupes, soit de manière ponctuelle en exportant
   des références 
 - *citer* des sources dans du texte en leur appliquant un style donné 
 - éditer les descriptions collectées pour les corriger et les
-  améliorer * *annoter les références bibliographiques* : vous pouvez
+  améliorer 
+- *annoter les références bibliographiques* : vous pouvez
   par exemple associer à une description des passages que vous trouvez
   particulièrement intéressants ; les notes prises sur des supports
   extérieurs à votre gestionnaire (cahiers, fichiers, etc.) peuvent
@@ -135,10 +134,10 @@ référence, je dois la créer dans chaque document.
   plusieurs dossiers sans pour autant occasionner de doublons ;
   étiquetter des références pour indiquer celles que vous jugez
   fondamentales ou signaler les références en attente de lecture ;
-  faire des renvois de références internes à sa bibliothèque ; créer des dossiers "dynamiques" : en
-sauvegardant une requête, vous créez un dossier où seront
-automatiquement classées toutes les références répondant aux critères
-enregistrés, indépendamment du classement manuel effectué. La liste n'est pas exhaustive. 
+  faire des renvois de références internes à sa bibliothèque ; créer
+  des dossiers "dynamiques" : en sauvegardant une requête, vous créez
+  un dossier où seront automatiquement classées toutes les références
+  répondant aux critères enregistrés, indépendamment du classement manuel effectué. La liste n'est pas exhaustive. 
 - *dédoublonner* les références ; on parle ici des descriptifs importés
   plusieurs fois et pas des références classées dans plusieurs
   dossiers