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4948e2be863f29db6b9ee51fc8f40394
mooc-rr
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345eb636
Commit
345eb636
authored
Apr 30, 2020
by
4948e2be863f29db6b9ee51fc8f40394
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journal/md2_doc_computationnel.md
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journal/md2_doc_computationnel.md
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345eb636
...
...
@@ -3,10 +3,13 @@
Constat : Vitrine (résultats) bien différent de l'envers du décor (calculs, souvent plus désorganisé)
Notes sur les outils
*
Jupyter intégré au gitlab
*
Jupyter intégré au gitlab => pour python, julia, R
*
export basé sur pandoc
*
Rstudio à installer et communiquer avec gitlab, pour R
*
OrgMode : le plus puissant , nécessite emacs
*
export basé sur pandac
*
OrgMode : le plus puissant , nécessite emacs, un peu plus dur à apprendre=> permet de combiner différents langages
*
export pleinement personnalisable (obligatoire)
*
capacité à écrire directement du latex qui sera passé tel quel lors de l'export
## Exemples de travaux aux résultats controversés
*
article en économie ayant conduit à des politiques d'austérité
...
...
@@ -30,7 +33,7 @@ Notes sur les outils
1.
manque de données
*
sources, données
*
choix non expliqués suspicieux => garder dans le cahier de lab
2.
erreurs dues aux ordinateurs
2.
erreurs dues aux ordinateurs
=> erreurs de calcul
*
logiciels propriétaires boites noires point and click, ou macro excel etc...
*
_mauvais utilisation des tableurs_
*
__on doit avoir confiance en chaque brique__
...
...
@@ -45,5 +48,44 @@ Notes sur les outils
*
quelqu'un peut trouver une erreur
*
quelqu'un peut tirer avantage à ma place
*
se donner les moyens que tout soit __inspectable__
### Outils à éviter et alternatives
*
outils propriétaires à éviter VS logiciels libres
*
_markown, orgmode_ VS _excel,word_
*
langages libres
*
utiliser formats textes et non binaires => meilleure durabilité
*
ne pas être soumis aux restrictions d'un seul hebergeur
*
__gitlab__ VS dropbox
## Le document computationnel : principes
Science moderne :
1.
données
2.
analyse, visualisations => parfois retours au données
3.
publication = partie émergée de l'iceberg
Recherche reproductible = pouvoir aller dans les 2 sens
### Objectifs du document
*
inspecter
*
refaire : vérifier, corriger, réutiliser
### Caractéristiques
*
vitrine : comme un article au format pdf
*
envers du décor : notebook jupyter par exemple
*
éditeur interactif
*
différents fragments de code avec résultats
*
images/ graphes
*
on peut choisir les parties à partager ou non
*
__1 seul document avec explication code résultat__
*
export possible
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