Update Readme.md

journal/Readme.md

@@ -27,4 +27,61 @@ avec option `-comment` pour ajouter une étiquette
 exiftools -comment <!__etiquette1__!>
 ```
 
+# Module 2 : Document computationnel
+
+
+1.  informations à avoir : 
+source et données
+expliciter ses choix
+-> le cahier de laboratoire est essentiel
+
+
+2.  l'ordinateur, source d'erreurs 
+exemple  : tableur -> erreurs de programmation 
+se reposer sur des piles logicielles complexes : on ne connait pas les composantsm
+
+3. Manque de rigueur et d'organisation 
+pas de backup
+pas d'historique
+pas de controle qualité
+en info : revue de code, intégration continue 
+
+4. outils à éviter : outils formats et services propriétaires
+
+*  standards ouverts ; format texte : markdown, orgmode, csv, hdf5
+* langages libres dcilab, R python
+* stocker données chez un hébergeur gratuit framadrop, gitlab/github
+* attention aux outils intuitifs (tableurs, outils graphiques ) : pas de tracabilité 
+
+les pb : 
+* manque d'info, procédure, accès 
+* erreur de calcul
+* manque de rigueur scientifique 
+
+changement de paradigme -> accès aux données et aux procédures de calcul
+
+##le document computationnel : principe
+objectifs : 
+inspecter les démarches utilisées
+refaire le calcul et l'analyse : vérifier / corriger / réutiliser
+
+contenu : 
+zones de texte au format markdown
+zone de code exécutable
+zone de résultat du code (graphique)
+
+petites zones de code 
+explication du 
+export en pdf ou html = doc final -> doc markdown
+pour chaque zone cachée ou exportée
+re-execution du code possible
+
+différents outils: jupyter, Rstudio, Orgmode
+
+-> inspection et rexecution
+-> export vers un doc final
+
+interopérabilité (différents langages) : bof pour jupyter et Rstudio
+
+