Added notes on video on comparative study of tools for each usage (journal,...

Added notes on video on comparative study of tools for each usage (journal, lab notebook) & associated questions

journal/module2-comparaison-outils.md

+# Vidéo : Analyse comparée des différents outils 
+
+## Un cours ou un tutoriel 
+
+Un notebook Jupyter est un document dynamique, facile à prendre en main. 
+
+## Un journal 
+
+Journal en org-mode : prise de notes sur les réunions, le code, etc. 
+
+- un seul auteur 
+- organisation chronologique
+- étiquettes sur chaque entrée ; très faciles à filtrer sur OrgMode
+- contient : notes, liens, codes (pour éventuellement pouvoir le réutiliser plus tard)
+
+## Cahier de laboratoire en org-mode
+
+Ici : cahier de labo informatique
+Sections : 
+- expériences
+- analyses 
+
+Au sein de ces sections : organisation dans l'ordre chronologique
+
+## Un article reproductible 
+
+Utilisation de org-mode 
+Permet d'avoir : 
+- plusieurs auteurs 
+- régénération des figures
+- permet au lecteur averti de revenir aux sources
+
+## Conclusion de la vidéo ... 
+
+Utilisation de Rstudio/knitr facile, mais navigation limitée. Ecriture d'un article : possible. 
+Org-Mode : utilisation plus complexe, mais navigation puissante. Pas spécifique d'un langage particulier.  
+Jupyter : environnement web, très facile d'accès
+
+**L 'outil importe peu** : ce qui importe c'est : 
+- collecter l'information
+- l'organiser et la rendre exploitable 
+- la rendre disponible
+
+Mais ces trois environnements sont matures. 
+
+## Notes d'après les questions
+
+Ces trois environnements fonctionnement sur tous les systèmes d'exploitations.
+Jupyter, OrgMode et Rstudio se distinguent par :
+a. La facilité d’installation et de prise en main
+b. L’année de création et le langage sous-jacent
+c. La capacité à rédiger des documents respectant un style bien spécifique et prêt à la soumission à un journal ou une conférence
+d. Le format de fichier utilisé (JSON pour Jupyter, Rmd pour Rstudio, Org pour Org-Mode)
+
+L'utilisation de l'un ou de l'autre des trois documents se justifie par : 
+- le type de document que l'on souhaite rédiger
+- le public amené à l'utiliser
+
+Pour que l'information d'un document computationnel soit exploitable, il est important de : 
+Gérer le document à l’aide d’un gestionnaire de version
+a. Structurer le document pour le rendre le plus lisible possible
+b. Expliquer en langage naturel l’idée générale derrière un calcul ainsi que pourquoi on prend telle ou telle décision de calcul
+c. Utiliser des mots-clés pour faciliter l’indexation et la navigation
+d. Réfléchir à qui l’information s’adresse 
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