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b05f84b9ee021dccccc4787bb5a09153
mooc-rr
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c20dff1f
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c20dff1f
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Mar 13, 2021
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b05f84b9ee021dccccc4787bb5a09153
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c20dff1f
# Prise de note / recherche reproductible
\ No newline at end of file
# Prise de note / recherche reproductible
# Module 2. la vitrine et l'envers du décor : le document computationnel
## Exemples récents d'études assez discutées
Leurs défauts : manque de rigueur et de transparence
## Pourqoi est-ce difficile ?
Difficultés les plus communes :
-
manque d'information (sources et données/résultats difficiles à vérifier ;
nécessité de faire un choix -> cahier de laboratoire pour tout consigner)
-
utilisation de l'ordinateur, source d'erreurs dans certains autoamatismes
(macro des tableurs ou de logiciel complexe)
-
manque de rigueur et d'organisation : pas de backup, d'historique, pas de
contrôle qualité
-
dimension culturelle et sociale : article = version simplifiée de la procédure
## Le document computationnel : principe
Rechreche reproductible : outils méthodologiques
Garder traces afin de : inspecter (justifier (auteur) et comprendre (lecteur)
le contenu de la publication ; refaire (vérifier, corriger et réutiliser)
Structure du doc computationnelle répond aux préoccupations précédentes :
description ; code ; résultat
## Prise en main de l'outil
Choix de Rstudio ; autres (Jupyter ; Org Mode)
Utilisation de R studio : langage R, KnitR (conversion en un document classique)
changer de type de document pour la publication : changer dans d'entête du
document markdown ; eple word, pdf ...
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