telechargement des données sur le site sentinelle dans le dossier de travail...

telechargement des données sur le site sentinelle dans le dossier de travail local. Modification du nom du fichier de données dans le code R: avant on travaillait avec dat_URL maintenant on travaille avec data_local.

module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd

@@ -2,11 +2,11 @@
 title: "Analyse de l'incidence du syndrôme grippal"
 author: "Konrad Hinsen"
 output:
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     theme: journal
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+    toc: true
 documentclass: article
 classoption: a4paper
 header-includes:
@@ -41,10 +41,18 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://
 | `geo_insee`  | Code de la zone géographique concernée (Code INSEE) http://www.insee.fr/fr/methodes/nomenclatures/cog/                            |
 | `geo_name`   | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis)                                                       |
 
+Nous avons téléchargé les données sur le site indiqué et fait une copie du fichier brut dans le dossier de travail local. Nous allons désormais travailler avec cette nouvelle version :
+
+```{r récupération data}
+data_local="C:/Users/Hg/Documents/R/MOOC/RECHERCHE REPRODUCTIBLE/mooc-rr/module3/exo1/incidence-PAY-3.csv"
+```
+
+
+
 La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`.
 ### Téléchargement
 ```{r}
-data = read.csv(data_url, skip=1)
+data = read.csv(data_local, skip=1)
 ```
 
 Regardons ce que nous avons obtenu: