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...@@ -34,7 +34,8 @@ lorsque l'on regarde un peu plus dans les détails les estimateurs de ...@@ -34,7 +34,8 @@ lorsque l'on regarde un peu plus dans les détails les estimateurs de
variance et le R^2. Il peut également y avoir des surprises dans le variance et le R^2. Il peut également y avoir des surprises dans le
graphique final selon les versions de bibliothèques utilisées. graphique final selon les versions de bibliothèques utilisées.
L'ensemble des calculs à effectuer est décrit ici: L'ensemble des calculs à effectuer est décrit ici avec les
indications sur comment contribuer:
https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/ https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/
Vous y trouverez notre réplication des calculs de Dallal et al. (en Vous y trouverez notre réplication des calculs de Dallal et al. (en
...@@ -47,7 +48,7 @@ faire à deux niveaux: ...@@ -47,7 +48,7 @@ faire à deux niveaux:
logistique, il suffit de bien inspecter les sorties produites et de logistique, il suffit de bien inspecter les sorties produites et de
vérifier qu'elles correspondent bien aux valeurs attendues. Pour vérifier qu'elles correspondent bien aux valeurs attendues. Pour
ceux qui ré-exécuteraient le notebook Python dans l'environnement ceux qui ré-exécuteraient le notebook Python dans l'environnement
Jupyter du MOOC, n'hésitez pas à consulter [[https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session01bis/courseware/66bc811404b8481da5f794de54681c5e/f8608bfb261b4c289b35b2cd19d5baf3/][les ressources de la Jupyter du MOOC, n'hésitez pas à consulter [[https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session01bis/jump_to_id/4ab5bb42ca1e45c8b0f349751b96d405][les ressources de la
section 4A du module 2]] qui expliquent comment y importer un section 4A du module 2]] qui expliquent comment y importer un
notebook. notebook.
2. un niveau plus difficile pour ceux qui souhaiteront le réécrire 2. un niveau plus difficile pour ceux qui souhaiteront le réécrire
...@@ -60,15 +61,14 @@ faire à deux niveaux: ...@@ -60,15 +61,14 @@ faire à deux niveaux:
Vous pourrez alors discuter sur le forum des succès et des échecs que Vous pourrez alors discuter sur le forum des succès et des échecs que
vous avez pu rencontrer. Pour cela: vous avez pu rencontrer. Pour cela:
- Vous publierez auparavant dans votre dépôt les différents notebooks - *Vous publierez auparavant dans votre dépôt les différents notebooks*
en prenant bien soin d'enrichir votre document des informations en prenant bien soin d'enrichir votre document des informations
(numéros de version, etc.) sur votre système et sur les (numéros de version, etc.) sur votre système et sur les
bibliothèques installées. bibliothèques installées.
- Vous indiquerez votre résultat (que ça soit un succès ou échec à - Vous indiquerez votre résultat (que ça soit un succès ou échec à
obtenir les mêmes résultats) en remplissant le [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.org][tableau]] dans ce même obtenir les mêmes résultats) en *remplissant ce [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]]* (vous avez
dépôt (vous avez les droits d'édition donc il vous suffit d'éditer les droits d'édition donc il vous suffit d'éditer les fichiers via
les fichiers via l'interface GitLab). Vous vérifierez les valeurs l'interface GitLab). Vous vérifierez les valeurs obtenues pour
obtenues pour
1) les coefficients de la pente et de l'intercept 1) les coefficients de la pente et de l'intercept
2) les estimations d'erreur de ces coefficients 2) les estimations d'erreur de ces coefficients
3) le goodness of fit 3) le goodness of fit
...@@ -88,7 +88,7 @@ vous avez pu rencontrer. Pour cela: ...@@ -88,7 +88,7 @@ vous avez pu rencontrer. Pour cela:
- R: BLAS, ggplot, dplyr si chargées - R: BLAS, ggplot, dplyr si chargées
Ne vous inquiétez pas si ces consignes vous semblent peu claires sur l'instant, Ne vous inquiétez pas si ces consignes vous semblent peu claires sur l'instant,
elles sont rappelées en haut du [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.org][tableau]] et vous vous rendrez vite elles sont rappelées en haut du [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]] et vous vous rendrez vite
compte s'il vous manque quelque chose quand vous essaierez de remplir compte s'il vous manque quelque chose quand vous essaierez de remplir
ce tableau. ce tableau.
......
...@@ -17,11 +17,11 @@ sera peut-être également votre cas! ...@@ -17,11 +17,11 @@ sera peut-être également votre cas!
1. Pour ceux qui ont suivi le parcours jupyter, recréer 1. Pour ceux qui ont suivi le parcours jupyter, recréer
l'environnement du MOOC sur votre propre machine en suivant les l'environnement du MOOC sur votre propre machine en suivant les
instructions données instructions données
[[https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session01bis/courseware/66bc811404b8481da5f794de54681c5e/f8608bfb261b4c289b35b2cd19d5baf3/][dans les ressources de la section 4A du module 2]]. [[https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session01bis/jump_to_id/4ab5bb42ca1e45c8b0f349751b96d405][dans les ressources de la section 4A du module 2]].
2. Vérifier si vous obtenez bien les même résultats que ceux 2. Vérifier si vous obtenez bien les même résultats que ceux
attendus. attendus.
3. Mettre à jour (vers le haut ou vers la bas) cet environnement et 3. Mettre à jour (vers le haut ou vers la bas) cet environnement et
vérifier si vous obtenez les mêmes résultats vérifier si vous obtenez les mêmes résultats
Comme précédemment, vous mettrez à jour le [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.org][tableau]] et vous discuterez Comme précédemment, vous mettrez à jour le [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]] et vous discuterez
sur le forum des succès et des échec que vous aurez rencontrés. sur le forum des succès et des échec que vous aurez rencontrés.
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