espaces insécables

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......@@ -6,7 +6,7 @@
#+OPTIONS: num:nil toc:t
#+PROPERTY: header-args :eval never-export
* Exercice 1 : Ré-exécuter n'est pas répliquer...
* Exercice 1 : Ré-exécuter n'est pas répliquer...
Même si la terminologie peut varier d'un auteur ou d'une communauté à
l'autre, il est important de comprendre que l'on peut distinguer
différents niveaux de "réplication" selon que l'on s'est contenté de
......@@ -33,13 +33,13 @@ dans les détails. Il peut également y avoir des surprises dans le
graphique final selon les versions de bibliothèques utilisées.
L'ensemble des calculs à effectuer est décrit ici avec les
indications sur comment contribuer :
indications sur comment contribuer :
[[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/][https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/]]
Vous y trouverez notre réplication des calculs de Dallal /et al./ (en
R), une mise en œuvre en Python et une en R (très similaires à ce que
vous avez pu utiliser dans le module 2). Cet exercice peut donc se
faire à deux niveaux :
faire à deux niveaux :
1. un niveau facile pour ceux qui repartiront du code dans le langage
qu'ils n'auront initialement pas utilisé et se contenteront de le
ré-exécuter. Pour cela, nul besoin de maîtriser la régression
......@@ -58,7 +58,7 @@ faire à deux niveaux :
implémenter. L'exercice en est d'autant plus instructif.
Vous pourrez alors discuter sur le forum des succès et des échecs que
vous aurez pu rencontrer. Pour cela :
vous aurez pu rencontrer. Pour cela :
- *Vous publierez auparavant dans votre dépôt les différents notebooks*
en prenant bien soin d'enrichir votre document des informations
(numéros de version, etc.) sur votre système et sur les
......@@ -66,24 +66,24 @@ vous aurez pu rencontrer. Pour cela :
- Vous indiquerez votre résultat (que ça soit un succès ou échec à
obtenir les mêmes résultats) en *remplissant ce [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]]* (vous avez
les droits d'édition donc il vous suffit d'éditer les fichiers via
l'interface GitLab). Vous vérifierez les valeurs obtenues pour :
l'interface GitLab). Vous vérifierez les valeurs obtenues pour :
1) les coefficients de la pente et de l'intercept
2) les estimations d'erreur de ces coefficients
3) le goodness of fit
4) la figure
5) la zone de confiance
- Pour chacun vous indiquerez si le résultat est :
- Pour chacun vous indiquerez si le résultat est :
- identique
- proche à moins de trois décimales
- très différent
- non fonctionnel (pas de résultat obtenu)
Vous indiquerez également dans ce tableau :
Vous indiquerez également dans ce tableau :
- un lien vers votre espace gitlab contenant les différents notebooks
- le nom du système d'exploitation utilisé
- le langage utilisé et son numéro de version
- les numéros des principales bibliothèques utilisées
- Python : numpy, pandas, matplotlib, statsmodels...
- R : BLAS, ggplot, dplyr si chargées
- Python : numpy, pandas, matplotlib, statsmodels...
- R : BLAS, ggplot, dplyr si chargées
Ne vous inquiétez pas si ces consignes vous semblent peu claires sur l'instant,
elles sont rappelées en haut du [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]] et vous vous rendrez vite
......
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