espaces insécables

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...@@ -6,7 +6,7 @@ ...@@ -6,7 +6,7 @@
#+OPTIONS: num:nil toc:t #+OPTIONS: num:nil toc:t
#+PROPERTY: header-args :eval never-export #+PROPERTY: header-args :eval never-export
* Exercice 1 : Ré-exécuter n'est pas répliquer... * Exercice 1 : Ré-exécuter n'est pas répliquer...
Même si la terminologie peut varier d'un auteur ou d'une communauté à Même si la terminologie peut varier d'un auteur ou d'une communauté à
l'autre, il est important de comprendre que l'on peut distinguer l'autre, il est important de comprendre que l'on peut distinguer
différents niveaux de "réplication" selon que l'on s'est contenté de différents niveaux de "réplication" selon que l'on s'est contenté de
...@@ -33,13 +33,13 @@ dans les détails. Il peut également y avoir des surprises dans le ...@@ -33,13 +33,13 @@ dans les détails. Il peut également y avoir des surprises dans le
graphique final selon les versions de bibliothèques utilisées. graphique final selon les versions de bibliothèques utilisées.
L'ensemble des calculs à effectuer est décrit ici avec les L'ensemble des calculs à effectuer est décrit ici avec les
indications sur comment contribuer : indications sur comment contribuer :
[[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/][https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/]] [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/][https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/]]
Vous y trouverez notre réplication des calculs de Dallal /et al./ (en Vous y trouverez notre réplication des calculs de Dallal /et al./ (en
R), une mise en œuvre en Python et une en R (très similaires à ce que R), une mise en œuvre en Python et une en R (très similaires à ce que
vous avez pu utiliser dans le module 2). Cet exercice peut donc se vous avez pu utiliser dans le module 2). Cet exercice peut donc se
faire à deux niveaux : faire à deux niveaux :
1. un niveau facile pour ceux qui repartiront du code dans le langage 1. un niveau facile pour ceux qui repartiront du code dans le langage
qu'ils n'auront initialement pas utilisé et se contenteront de le qu'ils n'auront initialement pas utilisé et se contenteront de le
ré-exécuter. Pour cela, nul besoin de maîtriser la régression ré-exécuter. Pour cela, nul besoin de maîtriser la régression
...@@ -58,7 +58,7 @@ faire à deux niveaux : ...@@ -58,7 +58,7 @@ faire à deux niveaux :
implémenter. L'exercice en est d'autant plus instructif. implémenter. L'exercice en est d'autant plus instructif.
Vous pourrez alors discuter sur le forum des succès et des échecs que Vous pourrez alors discuter sur le forum des succès et des échecs que
vous aurez pu rencontrer. Pour cela : vous aurez pu rencontrer. Pour cela :
- *Vous publierez auparavant dans votre dépôt les différents notebooks* - *Vous publierez auparavant dans votre dépôt les différents notebooks*
en prenant bien soin d'enrichir votre document des informations en prenant bien soin d'enrichir votre document des informations
(numéros de version, etc.) sur votre système et sur les (numéros de version, etc.) sur votre système et sur les
...@@ -66,24 +66,24 @@ vous aurez pu rencontrer. Pour cela : ...@@ -66,24 +66,24 @@ vous aurez pu rencontrer. Pour cela :
- Vous indiquerez votre résultat (que ça soit un succès ou échec à - Vous indiquerez votre résultat (que ça soit un succès ou échec à
obtenir les mêmes résultats) en *remplissant ce [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]]* (vous avez obtenir les mêmes résultats) en *remplissant ce [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]]* (vous avez
les droits d'édition donc il vous suffit d'éditer les fichiers via les droits d'édition donc il vous suffit d'éditer les fichiers via
l'interface GitLab). Vous vérifierez les valeurs obtenues pour : l'interface GitLab). Vous vérifierez les valeurs obtenues pour :
1) les coefficients de la pente et de l'intercept 1) les coefficients de la pente et de l'intercept
2) les estimations d'erreur de ces coefficients 2) les estimations d'erreur de ces coefficients
3) le goodness of fit 3) le goodness of fit
4) la figure 4) la figure
5) la zone de confiance 5) la zone de confiance
- Pour chacun vous indiquerez si le résultat est : - Pour chacun vous indiquerez si le résultat est :
- identique - identique
- proche à moins de trois décimales - proche à moins de trois décimales
- très différent - très différent
- non fonctionnel (pas de résultat obtenu) - non fonctionnel (pas de résultat obtenu)
Vous indiquerez également dans ce tableau : Vous indiquerez également dans ce tableau :
- un lien vers votre espace gitlab contenant les différents notebooks - un lien vers votre espace gitlab contenant les différents notebooks
- le nom du système d'exploitation utilisé - le nom du système d'exploitation utilisé
- le langage utilisé et son numéro de version - le langage utilisé et son numéro de version
- les numéros des principales bibliothèques utilisées - les numéros des principales bibliothèques utilisées
- Python : numpy, pandas, matplotlib, statsmodels... - Python : numpy, pandas, matplotlib, statsmodels...
- R : BLAS, ggplot, dplyr si chargées - R : BLAS, ggplot, dplyr si chargées
Ne vous inquiétez pas si ces consignes vous semblent peu claires sur l'instant, Ne vous inquiétez pas si ces consignes vous semblent peu claires sur l'instant,
elles sont rappelées en haut du [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]] et vous vous rendrez vite elles sont rappelées en haut du [[https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/moocrr-session1/moocrr-reproducibility-study/blob/master/results.md][tableau]] et vous vous rendrez vite
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