Update Journal.md module 2.1 et 2.2

journal/Journal.md

@@ -98,4 +98,44 @@ Solutions facile à mettre en oeuvre :
 - docu wiki
 
 Solutions un peu plus complexes mais plus puissante : 
-- gitlab
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+- gitlab
+- 
+
+## Module 2 - Le document computationel
+
+Objs : 
+- tracabilité des calculs et résultats
+- code + résultats dans un doc scientifique
+- 3 outils possibles : Jupyter / RStudio / Emacs&Org-mode
+
+**Rigeur** et **transparence** nécessaire pour permettre la reproductibilitée
+
+### Difficultés
+
+cause technique sur la difficulté de la reproductibilité : 
+- sources et données (non disponibles)
+- choix (sur les données)
+- ordinateur = sources d'erreurs
+ - tableur 
+ - pile logicielle complexe (logiciel proprio)
+ - bug
+- manque rigeur et organisation
+ - non backup
+ - non histo
+ - pas controle de qual
+- dimension culturelle et saines
+ - (article : version simplifié du proto)
+
+craintes :
+- on montre nos faiblesses
+- qqun peut trouver une erreur
+- qqun peut en tirer avantage
+- LEGITIMES : données sensibles / ressources limitées
+
+solutions :
+- format texte et non proprio
+    ==> formats textes : markdown, orgmode, csv, hdf5, ...
+- logiciel et langage libre
+    ==> scilab, R, python
+- stockage data
+    ==> famadrop, gitlab, github
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