Update analyse-syndrome-grippal.Rmd

parent bd3fb38c
...@@ -21,9 +21,13 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ...@@ -21,9 +21,13 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
## Préparation des données ## Préparation des données
Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). S'il n'existe pas de fichier local pour les données (une copie doit être conservée pour la traçabilité), nous les récupérons en local sous forme de tableau CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet en local, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. Nous lisons ce jeu de données dans un second temps.
```{r} ```{r}
data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" if(!file.exists("./incidence-PAY-3.csv")){
data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv"
data_dwnld = read.csv(data_url)
write.csv(data_dwnld, "./incidence-PAY-3.csv", row.names = FALSE)
}
``` ```
Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json):
...@@ -44,7 +48,7 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// ...@@ -44,7 +48,7 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://
La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`.
### Téléchargement ### Téléchargement
```{r} ```{r}
data = read.csv(data_url, skip=1) data = read.csv("./incidence-PAY-3.csv", skip=1)
``` ```
Regardons ce que nous avons obtenu: Regardons ce que nous avons obtenu:
......
Markdown is supported
0% or
You are about to add 0 people to the discussion. Proceed with caution.
Finish editing this message first!
Please register or to comment